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学会
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http://scieng.library.ubc.ca/coden/ - Protein Data Bank
タンパク質の立体構造情報をダウンロードできる、研究に必須のサイト。
http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do - PDBj
Protein Data Bankの日本語版。
http://www.pdbj.org/index_j.html - ExPASy - Compute pI/Mw tool
アミノ酸配列からタンパク質の等電点と分子量を求められる。
http://web.expasy.org/compute_pi/ - Translate tool
DNA配列またはRNA配列をアミノ酸配列に翻訳してくれる。
http://web.expasy.org/translate/ - DNA calculator
オリゴDNAの配列特性を計算してくれる。分子量、Tm値、GC比を算出できるソフトとして有名。
http://www.sigma-genosys.com/calc/DNACalc.asp - TM値計算
リバースの配列も出してくれるので、変異体作成用のプライマー設計の際に便利。
http://app.javac.biz/tools/caltm-2 - Primer-BLAST
あるDNA配列の一部を増幅するためのプライマーを設計するのに便利。(類似ソフトではPrimer3なども有名だが、個人的にはこちらのほうが見やすいと思う。使い方ムービーはこちらhttp://togotv.dbcls.jp/20100511.html)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ - Fluorescence Spectra Viewer
各種の蛍光色素や蛍光タンパク質のスペクトルを確認することができる。
http://ja.invitrogen.com/site/jp/ja/home/Products-and-Services/Applications/Cell-Analysis/Labeling-Chemistry/Fluorescence-SpectraViewer.html
便利ソフト
- ApE
DNAワークの必需品。
http://biologylabs.utah.edu/jorgensen/wayned/ape/ - Pymol
http://www.pymol.org/
その他
- MIT OpenCourseWare: Free Online Course Materials
マサチューセッツ工科大学の公開講義。
http://ocw.mit.edu/index.htm - TED: Ideas worth spreading
様々な分野の第一線の人物が集まり定期的にカンファレンスを開催しているグループ。プレゼンの動画がためになる。
http://www.ted.com/ - フォトゲット
他ラボの人との学会写真の共有に便利。(幹事さんはユーザー登録が必要)
http://photoget.jp/
試薬関連
http://macs.esmc.nagoya-u.ac.jp/iasor6/
http://nu.lab-support.net/
https://www.nacalai.co.jp/ss/ec/EC-LoginX.cfm
http://www.sigmaaldrich.com/japan.html
http://www.wako-chem.co.jp/siyaku/index.htm
http://www.tokyokasei.co.jp/
http://www3.kanto.co.jp/catalog/Csearch.aspx
http://www.nacalai.co.jp/
